Cuando creamos una lista estamos creando un objeto de la clase list, que tiene definido un conjunto de métodos:

lista.append   lista.copy     lista.extend   lista.insert   lista.remove   lista.sort
lista.clear    lista.count    lista.index    lista.pop      lista.reverse

Métodos de inserción: append, extend, insert

>>> lista = [1,2,3]
>>> lista.append(4)
>>> lista
[1, 2, 3, 4]

>>> lista2 = [5,6]
>>> lista.extend(lista2)
>>> lista
[1, 2, 3, 4, 5, 6]	

>>> lista.insert(1,100)
>>> lista
[1, 100, 2, 3, 4, 5, 6]

Métodos de eliminación: pop, remove

>>> lista.pop()
6
>>> lista
[1, 100, 2, 3, 4, 5]

>>> lista.pop(1)
100
>>> lista
[1, 2, 3, 4, 5]

>>> lista.remove(3)
>>> lista
[1, 2, 4, 5]

Métodos de ordenación: reverse, sort,

>>> lista.reverse()
>>> lista
[5, 4, 2, 1]

>>> lista.sort()
>>> lista
[1, 2, 4, 5]

>>> lista.sort(reverse=True)
>>> lista
[5, 4, 2, 1]

>>> lista=["hola","que","tal","Hola","Que","Tal"]
>>> lista.sort()
>>> lista
['Hola', 'Que', 'Tal', 'hola', 'que', 'tal']
>>> lista=["hola","que","tal","Hola","Que","Tal"]
>>> lista.sort(key=str.lower)
>>> lista
['hola', 'Hola', 'que', 'Que', 'tal', 'Tal']

Métodos de búsqueda: count, index

>>> lista.count(5)
1

>>> lista.append(5)
>>> lista
[5, 4, 2, 1, 5]
>>> lista.index(5)
0
>>> lista.index(5,1)
4
>>> lista.index(5,1,4)
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
ValueError: 5 is not in list

Método de copia: copy

>>> lista2 = lista1.copy()

Updated: